The pun "Alma Matters" could refer to the Latin expression "Alma Mater", meaning the University in which one has been ("alma mater" is Latin for the mother who donates life and feeds her children). The meaning of the title: to be "alma", i.e. to be benevolent and good, has a great importance to someone, somewhere, but not to everyone. And that is the reason why the author debates with an imaginary fellow who questions his life and his choices. At the same time the title suggests that education (here under the term "Alma" - "Mater" is implied) does actually have a great importance for the mind, body and soul of a human being.

Morrissey, in an interview, says of the song:
"Well.. it really does mean something specific. I think it means that we should be pleased and proud of the female side of our character, of our nature. Or if we're female, we should be proud of the male side of our character and give it just as much importance as the other side. So, everything's fine, it doesn't matter how you behave."

Alma Matters: Hugh Clark from Scotland refers that Alain Whyte used to live in Camden in a street called Alma Street. Alain seems to live in a different house in Camden now.

Il gioco di parole "Alma Matters" potrebbe riferirsi all'espressione latina "Alma Mater", intendendo con essa l'Università alla quale si è stati ("alma mater" è la madre che dà la vita e che nutre). Il significato del titolo può essere che la bontà, la gentilezza (alma significa benigna, benevolente, buona) ha grande importanza per alcuni, non per tutti. E di questo l'autore si lamenta verso un immaginario interlocutore che mette in discussione la sua vita e le sue scelte. Nello stesso tempo il titolo sembra suggerire che l'educazione e l'istruzione, rappresentate dalla parola "Alma" (sottintesa "Mater"), contano molto per la mente, per il corpo e per l'anima di un essere umano.

Morrissey, in una intervista, dice di questa canzone:
"Beh, significa davvero qualcosa di molto specifico. Penso che significhi che dovremmo essere contenti ed orgogliosi del lato femminile del nostro carattere, della nostra natura. Oppure, se si è donne, che si dovrebbe essere orgogliosi del lato maschile del nostro carattere e dargli la stessa importanza dell'altro nostro lato. Così, tutto va bene e non importa il modo in cui agisci."

Alma Matters: Hugh Clark dalla Scozia riferisce che Alain Whyte viveva in una casa a Camden in una strada chiamata Alma Street. Sembra che ora Alain viva in una casa diversa ora sempre a Camden, una zona a nord di Londra.